L'artémia dans son biotope ingurgite en les filtrant toutes les micro-particules en suspension dans l'eau sans aucune sélection autre que la taille des particules. C'est son système digestif qui fera la sélection. Selon la littérature japonaise les particules ne doivent pas être surpérieures à 30 microns (1000 microns = 1 mm) pour l'artémia adulte et pas plus de 4 à 5 microns pour le nauplius.
Le fait qu'Artémia ingurgite toute les particules organiques ne veut pas dire que toutes soient favorables à son développement.
Ce sont les micro-algues ou phytoplancton dont le taux de protéines est important qui lui donnent les meilleures performances de vitesse de croissance.

Lorsque ce phytoplancton devient rare, Artémia se met sur le fond vaseux, cesse de nager sur le dos et remue les particules organiques sédimentées afin de les mettre en suspension pour les ingurgiter. Les colonies d'artémias se concentrent en grand nombre dans les trous de bassin de marais salant. Là où justement il y a le plus de particules organiques d'accumulées et aussi de bactéries biodégradantes.

Artémia se nourrit aussi bien des déchets de cellules organiques végétales et animales que de tous les micro-organismes compatibles à son système de filtration. Il est prédateur aussi bien de bactéries que de protozoaires que de dinoflagellés que de rotifères etc...

Le fait qu'Artémia ingurgite toutes les micro-particules en suspension et qu'il soit très sensible à la moindre toxicité en fait un agent de détection particulièrement probant pour les tests d'innocuité de produits alimentaires préalablement micro broyés. Différents         protocoles de tests de toxicité par le biodétecteur Artémia ont été mis au point à Genève. 

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